中国农业大学按照“顶天立地”的科技工作指导方针，坚持面向国民经济主战场，以高水平和实用型的科研成果为我国农业现代化服务，在生物与农业领域和食品科学领域的研究居国内领先水平。学校在承担国家重大科研项目、科技成果产出、科研基地建设等方面都取得了显著成绩，部分科研指标数据居全国高校前列，国际论文等科研产出已与世界著名农业高校看齐。

学校在农业生命科学、植物生产、动物生产与动物医学、农业资源环境、食品科学技术、农业工程科学与技术、人文社会科学等领域开展大量研究，承担了国家科技重大专项、“973”计划、“863”计划、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、公益性行业科研专项、现代农业产业技术体系以及教育部、北京市等其它省部委的科研项目。近年来，纵向经费占科研总经费的90%左右。