学校学生社团有着悠久的历史和广泛的影响力。目前，全校已注册校级社团77家，院级社团20余家，分为公益、科技创新、理论实践、文化艺术、体育五大类，约有社团成员7000余人，形成了具有农大特色的"校—院"两级社团发展体系。

学校社团通过开展各具特色的品牌活动，逐渐形成了"张扬青春，热心公益，关注社会，投身实践"的社团文化。其中，农村发展研究会以关注、解决三农问题为己任，创办"乡土乡亲"杂志引起社会广大关注，并得到了时任总理温家宝的亲笔回信；峰云社社员担任08年北京奥运会火炬手，将奥运圣火送上世界之巅；黑白灰话剧等社团打造农大首部社团大型原创音乐剧和舞台剧；农村发展研究会、挚友社被评为"全国优秀学生社团"。全校平均每学期开展社团活动百余场，形成了一系列有品质、有内涵、有影响的品牌活动，将时代热点、学校育人工作重点、大学生兴趣关注点紧密结合，成为校园文化的鲜亮风景线。